Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FANCD2Q9BXW9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCD2Q9BXW9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms