Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms