Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGIP1Q9BQI5 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms