Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VSIG2Q96IQ7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms