Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGF29Q96ES7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms