Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTP4A1Q93096 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTP4A1Q93096 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTP4A1Q93096 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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