Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC4Q92889 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms