Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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