Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms