Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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