Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CARMIL3Q8ND23 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CARMIL3Q8ND23 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms