Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L2Q8NAA4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms