Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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LRRC17Q8N6Y2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC17Q8N6Y2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC17Q8N6Y2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC17Q8N6Y2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRRC17Q8N6Y2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC17Q8N6Y2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC17Q8N6Y2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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LRRC17Q8N6Y2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LRRC17Q8N6Y2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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