Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LRRC28Q86X40 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms