Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRCQ7RTU9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms