Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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