Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FBXO42Q6P3S6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms