Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CATSPEREQ5SY80 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms