Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms