Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF2Q5BJF6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms