Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TDRD12Q587J7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms