Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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