Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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