Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LETM2Q2VYF4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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