Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECM1Q16610 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms