Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms