Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC1Q15915 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms