Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC1A5Q15758 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms