Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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UBE3CQ15386 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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UBE3CQ15386 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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UBE3CQ15386 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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UBE3CQ15386 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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UBE3CQ15386 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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UBE3CQ15386 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3CQ15386 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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