Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms