Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMD6Q15008 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms