Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB1Q14028 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms