Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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CKAP5Q14008 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CKAP5Q14008 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CKAP5Q14008 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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