Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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APOFQ13790 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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APOFQ13790 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOFQ13790 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOFQ13790 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOFQ13790 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOFQ13790 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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