Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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