Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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