Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms