Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf61Q13536 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms