Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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