Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms