Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MKRN4PQ13434 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms