Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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