Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDRQ13258 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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