Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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TRAF1Q13077 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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