Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAF2Q12933 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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