Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC10A2Q12908 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC10A2Q12908 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms