Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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