Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC15Q0P6D6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms