Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms