Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX4Q06945 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms